Ajutat de aliați, Kenshin își înfruntă în 1879 cel mai puternic vrăjmaș: fostul cumnat, Enishi Yukishiro, care a jurat răzbunare laolaltă cu acoliții săi.
Înainte de a fi un protector, Kenshin era un asasin temut cunoscut sub numele de Battosai. Dar când o întâlnește pe blânda Tomoe Yukishiro, povestea lui se schimbă.
Kenshin se antrenează cu maestrul său pentru a învăța ultimele tehnici care îi vor permite să-l împiedice pe Shishio să dea jos guvernul și să arunce Japonia în haos.
Kenshin Himura, un războinic devenit pacifist, confruntă cu reticență un asasin nemilos, care complotează să răstoarne guvernul Meiji cu ajutorul unor mercenari.